PhpStormは gitコマンドをインストールさせようとしてくるけど、もうSourceTreeインストールしてるしその中にgit.exeがあるんだから そっちを使いたい
設定 ⇒ バージョン管理 ⇒ Git でSourceTreeのgit.exe を設定すればOK
C:\Users\hogehoge\AppData\Local\Atlassian\SourceTree\git_local\bin\git.exe

本当は C:\Users\hogehoge\AppData\Localの代わりに %LOCALAPPDATA% を使いたいけど
PhpStormには環境変数を理解する能力が無いので使えない